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PAPPSO - Protéomique

Plate-forme d’Analyse Protéomique de Paris Sud-Ouest

PAPPSO est spécialisé dans l’analyse et l’identification des protéines issues des matériels biologiques. PAPPSO est adossé pour partie à MICALIS et pour l’autre partie, à l’unité UMR Biologie Végétale. La plate-forme est membre du réseau protéomique Massprot’INRA et anime le réseau RUSP2 qui regroupe les protéomistes d’Ile-de-France Sud.

PAPPSO réunit deux plateaux techniques complémentaires localisés sur deux sites proches :

• Jouy-en-Josas (78)

• Moulon (91)


La complémentarité de leurs compétences et équipements permet à PAPPSO de proposer une expertise large depuis la séparation des protéines jusqu’à leur identification, caractérisation et quantification.

La plate-forme s’adresse prioritairement aux laboratoires INRA et aux membres de l’IFR87, mais elle est aussi largement ouverte à tout laboratoire. PAPPSO est une plate-forme stratégique INRA et a été labellisée IBiSA en 2009.

Missions :

• Analyser les matériels biologiques :

o Identification des protéines après séparation par électrophorèse mono-ou bi-dimensionnelle par empreinte de masse peptidiques (spectrométrie de masse Maldi-Tof)

o Vérification de pureté des protéines par mesure de masse totale

o Identification de protéines en mélange ou de protéines non résolues par électrophorèse (spectrométrie de masse MS/MS)

o Etude structurale de peptides (modifications post-traductionnelles)

o Séquençage partiel de novo de protéines issues d’organismes au génome non séquencé

• Développer, tester et valider des modes opératoires pour l’analyse des matériels biologiques. Identification de protéines en mélange par chromatographie liquide couplée à de la spectrométrie de masse en tandem (LC-MS/MS)

• Former les utilisateurs à l’analyse des matériels biologiques. Analyse par empreinte de masse peptidique

Spécificités :


1] Objets d’études : Microorganismes (Jouy) et plantes (le Moulon)

- Approches méthodes
- Protéomique quantitative sans marquage
- Phosphoprotéomique
- Peptidomique
- Analyse de surfaces bactériennes


2] Expertises :

Bioinformatique, Spectrométrie de masse, Electrophorèse 2D, Traitement statistique

http://pappso.inra.fr

Rédacteur : JM
Date de création : 25/02/2010
Date de dernière mise à jour : 15/03/2010