Quelques chiffres- 1 kg de bactéries dans un intestin humain adulte
- le microbiote : 10 à 100 fois le nombre de cellules de notre corps
- notre tube digestif : 400 m2 de surface de contact
- 1000 espèces de bactéries représentent 90 % de la population totale
- Plusieurs milliers d’espèces bactériennes différentes dans un tube digestif
- 100 milliards de bactéries par gramme de selles
D’où proviennent les bactéries du microbiote ? Le nouveau-né humain, stérile à la naissance, est rapidement colonisé par un microbiote provenant des contacts humains, principalement la mère, et de l'environnement.
Diversité du microbiote humain
Les 2/3 des espèces bactériennes intesintales dominantes qu'héberge chaque individu adulte lui sont totalement spécifiques. Le 1/3 restant est plus ou moins partagé. L’équilibre du microbiote se constitue progressivement de la naissance à l’age adulte et c’est sans doute de cette longue « histoire » que résulte l’unicité de chaque individu. L'alimentation, la prise d'antibiotiques et l'hygiène jouent de rôles importants dans les séquences de colonisation bactérienne.
On peut cependant observer des similitudes entre individus au niveau de grands « groupes » rassemblant plusieurs genres bactériens. Trois groupes (ou phylas) sont ainsi dominants : les bactéroidetes, les firmicutes et les actinobacteria.
Quelles conséquences pour l'Homme d'une telle diversité ? On ne connait pas les conséquences pour l'Homme d'une telle diversité puisque, globalement chez l'homme en bonne santé, il n'y a pas de différences dans le fonctionnement du système digestif chez les individus en bonne santé. La diversité du microbiote pourrait être liée à l'équilibre et la préservation de l'écosystème tout au long de la vie. Le projet "métagénome" contribuera sans doute à répondre à ces questions. Evolution dans le temps du microbiote- 10 individus adultes ont rarement plus d’une espèce bactérienne en commun ;
- A 2 mois, le nourrisson héberge un microbiote dont la complexité
semble proche de celle de l’adulte. Mais les fonctions assurées par ce
microbiote sont différentes ;
- A l'échelle de la population européenne, on observe des différences régionales chez les enfants, mais pas chez les adultes ;
- Chez les personnes âgées (au-delà de 70 ans), le microbiote devient de plus en plus complexe avec l'âge.
Une grande stabilité au cours de la vie A l'âge adulte, le microbiote est organisé en un écosystème hiérarchisé, avec des espèces dominantes (en nombre) et des dominées. Chez un même individu en bonne santé, les grands équilibres entre espèces varient peu en dépit d'éventuelles modifications du régime alimentaire, y compris lors des variations de repas. Un équilibre « global » semble se créée. Cependant on ne peut pas exclure qu’il y ait des différences dans les fonctions de ce microbiote selon les apports alimentaires. Les flatulences observées lors de la consommation de certains plats en sont une illustration. Chez les personnes âgées, de nouvelles espèces apparaissent. On ne sait pas encore si ces modifications sont liées à la plus grande sensibilité des personnes âgées à l'infection par exemple.
Un "organe '" essentiel pour la santé et sur le bien-être
Alors
que nous associons souvent « Bactérie » et « Maladie », notre microbiote digestif en équilibre comprend essentiellement des bactéries dont les
fonctions nous sont bénéfiques en termes de nutrition et de santé.
Elles contribuent à quatre fonctions majeures dont certaines ne sont
établies qu’après l’age de 2 ans chez l’enfant suggérant une maturation
nécessaire de notre microbiote digestif :
- la physiologie
intestinale et le développement du tube digestif : épaisseur de la
muqueuse intestinale, taille des villosités et de la bordure en brosse,
angiogénèse (développement du réseau sanguin) ;
- la nutrition et
la dégradation de composés d’origine alimentaire indigestibles tels que
la fermentation des fibres végétales et la bioconversion de
micronutriments. Ces transformations peuvent conduire à la production
de substances bénéfiques pour la santé ;
- l’éducation du système
immunitaire . En l'absence de microbiote , le système immunitaire est
sous-développé mais d'un autre côté, les maladies inflammatoires ne se
produisent pas sans microbiote ;
- la protection contre la colonisation du tube digestif par des microorganismes pathogènes.
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